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宏基因組測序

宏基因組測序是一种利用高通量测序技术完成微生物群落所有物种基因组的检测和功能分析的方法。宏基因組測序技术无需微生物的分离纯化培养,能够快速有效地获得整个微生物群落的基因信息,可以更加深入地对群落结构、物种分类、系统进化、基因功能及代谢网络等方面进行研究。

應用領域
1、群落微生物物種分類
2、群落功能分析
3、未知物種鑒定

技術路線

分析內容
標准信息分析
1. 测序质量评估与数据过滤
2. 过滤宿主数据(若有宿主)
3. 宏基因组组装
4. 组装结果统计与评估
5. 物种注释及物种丰度统计
6. 基因预测
7. 基因丰度分析
8. 基因功能注释(KEGG, eggNOG, CAZy数据库)
9. 基因功能丰度分析及聚类热图
10. 多样品间比较分析(分别在物种和功能水平上的PCA分析和聚类分析)

定制化信息分析
可結合客戶的需求,協商確定其他定制化信息分析服務內容。

樣品要求
土壤:10 g;粪便:3-5 g;血液:10 mL;污泥/沉积物:5-10 g;
DNA:总量 ≥ 1 μg、浓度 ≥ 20 ng/μL、1.8 < OD260/280 < 2.0。

項目周期
約50個工作日,視樣本類型而定。